當反滲透膜元件發生了氧化、背壓和機械性等不可恢復性的損壞，或者隨著使用年限增長產生性能的自然衰減時，反滲透系統通過在線、甚至離線的化學清洗仍無法滿足系統的脫鹽率和產水量的要求，我們認為就需要進行膜元件的更換。
    通過對反滲透膜進行性能評價，可以確定一個經濟安全的膜元件更換方案。反滲透膜元件性能評價可以通過在線的探針或離線的平臺測試來確認系統中每一支膜元件的性能現狀。通常一個水處理系統的更換計劃會在 3~5 年內完成，每一年可以通過性能評價來確定更換部分反滲透膜元件，以保證水處理系統優異的性能表現。

    如果不是進行逐年的更換，而是選擇在 3~5 年后進行全部更換，雖然更換的膜元件數量一致，但對于每一年系統的維護可能會花費更多的藥劑與其他成本。所以我們推薦水處理系統進行每一年的部分更換計劃。
    幾種典型的更換方案：
    (1)更換單組全部膜元件
    (2)更換某一段全部膜元件
    (3)更換某一段壓力容器內同樣數量的前幾支膜元件
    (4)更換某壓力容器內全部膜元件
    如果有足夠多的新的膜元件可供替換，第一種方案是較好的的選擇；第二和第三種方案相對來說比較經濟與安全，盡管新舊膜元件之間存在著壓力降的不同，但是如果系統流量保持平衡，對整個系統不會產生不利影響，采用第四種方案的情況下，使用舊膜元件的壓力容器比使用新膜元件的壓力降較高，因此每次調整之后舊膜元件的回收率會比正常情況下高，這樣可能會導致新問題的出現。